São órgãos sociais do CIVISA: a Assembleia Geral, a Direção e o Conselho Fiscal.

Assembleia Geral

Presidente - Doutor João Luís Roque Batista Gaspar

1.º Secretário - Doutor José Manuel Rodrigues Pacheco (representante da Universidade dos Açores)

2.º Secretário -  Major Rui Pedro Massa de Andrade (representante da Região Autónoma dos Açores)

Direção

Presidente - Doutora Maria Gabriela Pereira da Silva Queiroz​

Vogal - Doutora Rita Lúcio Carmo de Almeida (representante da Universidade dos Açores)

Vogal - Engenheiro Luís Gabriel de Carvalho Bettencourt Moniz Barreto​ (representante da Região Autónoma dos Açores)

Conselho Fiscal

Presidente - Doutora Maria da Graça Câmara Batista (representante da Universidade dos Açores)

​​Vogal - Dr. Luís Manuel Martins Brum​ (representante da Região Autónoma dos Açores)

Vogal - Doutor Rúben Mota Cordeiro (membro, Revisor Oficial de Contas, representante da J. Silva Cardoso e Ruben Cordeiro, Sociedade de Revisores Oficiais de Contas, Lda.)