Na ilha das Flores é possível observar um conjunto de falhas e de filões agrupados em três famílias principais de acordo com a respectiva direcção dominante. As estruturas de direcção N30º-40ºW prolongam-se para domínios submarinos e exercem um claro controlo na morfologia actual da ilha. As de direcção N15º-30ºE são de natureza vertical a subvertical e condicionam a irregularidade da orla costeira a NE e a SW e o traçado de algumas linhas de água. As estruturas de direcção N-S, embora com expressão subordinada à das famílias anteriores, exercem um importante controlo na distribuição de alguns centros vulcânicos, em particular no sector norte da ilha.